CASFB/MIBMiK/5

Nazwa Centrum

Centrum Analizy Struktury i Funkcji Białek MIBMiK

Lokalizacja:

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Nazwa aparatury:

Stanowisko badawcze do analizy białek metodami fizykochemicznymi zawierające takie urządzenia jak: spektrofotometr, fluorymetr płytkowy, szybkoobrotowe wirówki oraz wirówka analityczna

Opis aparatury:

Wyposażenie badawcze tego stanowiska składa się z:

Spektrofotometr Nanodrop ND-8000 pozwala na równoczesny pomiar absorbancji 8 próbek białka. Dzięki bardzo małej objętości pomiarowej, wynoszącej 1 µl oraz dużemu zakresowi dynamicznemu nie zachodzi konieczność dokonywania rozcieńczeń próbki. Urządzenie to umożliwia dokonywanie pomiarów w pełnym zakresie spektrum od 220 nm do 750 nm. Aparat ten pozwala także na pomiar stężenia DNA/RNA w zakresie 2 do 3700 ng/µl.

Fluorymetr płytkowy Tecan Infinte M1000. Dzięki zastosowaniu monochromatorów nowego tupu (quad4) instrument ten działa we wszystkich podstawowych trybach detekcji- intensywności fluorescencji, polaryzacji fluorescencji oraz luminescencji. Znajduje także zastosowanie w pomiarach typu FRET lub TR-FRET. Pozwala na wykorzystanie wszystkich dostępnych płytek – zawierających od 96 do 1536 dołków. Umożliwia dostosowanie „głębokości” pomiaru do objętości próbki.

Szybkoobrotowa wirówka podłogowa firmy Beckman: Avanti J-30, Avanti J-26. Dzięki zastosowaniu rotorów o różnej objętości i szybkości wirowania, instrumenty te są stosowane na różnych etapach procesu nadekspresji białek rekombinowanych. Między innymi, umożliwiają odwirowanie pelletu bakteryjnego równocześnie z 6 litrów hodowli.

Wirówka analityczna ProteomeLab XL-I. W ostatnich latach dzięki nowoczesnym algorytmom analizy danych oraz rozwojowi sprzętu, metoda wirowania analitycznego ponownie zdobywa coraz większą popularność. Analiza sedymentacji makrocząsteczek, prowadzona w czasie rzeczywistym pozwala na precyzyjne wyznaczenie takich parametrów makrocząsteczek, głównie białek, jak: masa cząsteczkowa, stężenie, współczynnik sedymentacji, stałe powinowactwa i dysocjacji oraz ocena stanu oligomeryzacji, stechiometria, jednorodność próbki, kształt cząsteczki itp. Stosowane są dwa podstawowe eksperymenty pomiarowe – szybkości sedymentacji oraz równowagi sedymentacyjnej oraz różne systemy optyczne – absorpcyjny i interferencyjny. Wirówka analityczna ProteomeLab XL-I zainstalowana w Międzynarodowym Instytucie Biologii Molekularnej i Komórkowej jest pierwszym tego typu urządzeniem dostępnym w Polsce.

Rodzaje usług świadczonych na aparaturze:

Biofizyczna analiza makromolekuł bioorganicznych (głównie białek i kwasów nukleinowych) metodami sedymantacyjnymi w oparciu o wirówke analityczną Beckman ProteomeLab XI-I. Umożliwia ona precyzyjne wyznaczenie takich parametrów makrocząsteczek, jak: masa cząsteczkowa, stężenie, współczynnik sedymentacji, stałe powinowactwa i dysocjacji oraz ocenę stanu oligomeryzacji, stechiometrii wiązania, jednorodności próbki, kształtu cząsteczki, itp.